Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH8

NEURL3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL3Q96EH8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEURL3Q96EH8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NEURL3Q96EH8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NEURL3Q96EH8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NEURL3Q96EH8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NEURL3Q96EH8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NEURL3Q96EH8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEURL3Q96EH8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEURL3Q96EH8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEURL3Q96EH8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEURL3Q96EH8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEURL3Q96EH8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEURL3Q96EH8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEURL3Q96EH8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NEURL3Q96EH8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
NEURL3Q96EH8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NEURL3Q96EH8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEURL3Q96EH8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEURL3Q96EH8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEURL3Q96EH8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEURL3Q96EH8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEURL3Q96EH8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEURL3Q96EH8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEURL3Q96EH8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
NEURL3Q96EH8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEURL3Q96EH8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEURL3Q96EH8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEURL3Q96EH8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEURL3Q96EH8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEURL3Q96EH8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEURL3Q96EH8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEURL3Q96EH8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEURL3Q96EH8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEURL3Q96EH8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEURL3Q96EH8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEURL3Q96EH8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEURL3Q96EH8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEURL3Q96EH8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEURL3Q96EH8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEURL3Q96EH8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEURL3Q96EH8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NEURL3Q96EH8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEURL3Q96EH8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEURL3Q96EH8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEURL3Q96EH8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEURL3Q96EH8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEURL3Q96EH8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEURL3Q96EH8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEURL3Q96EH8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEURL3Q96EH8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEURL3Q96EH8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEURL3Q96EH8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms