Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTP4Q96DX8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RTP4Q96DX8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTP4Q96DX8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTP4Q96DX8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTP4Q96DX8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTP4Q96DX8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTP4Q96DX8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RTP4Q96DX8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RTP4Q96DX8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms