Protein–RNA interactions for Protein: Q96DU9

PABPC5, Polyadenylate-binding protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC5Q96DU9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PABPC5Q96DU9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PABPC5Q96DU9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PABPC5Q96DU9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PABPC5Q96DU9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PABPC5Q96DU9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PABPC5Q96DU9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PABPC5Q96DU9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PABPC5Q96DU9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PABPC5Q96DU9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PABPC5Q96DU9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PABPC5Q96DU9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PABPC5Q96DU9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PABPC5Q96DU9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PABPC5Q96DU9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PABPC5Q96DU9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PABPC5Q96DU9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PABPC5Q96DU9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PABPC5Q96DU9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PABPC5Q96DU9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PABPC5Q96DU9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PABPC5Q96DU9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PABPC5Q96DU9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PABPC5Q96DU9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PABPC5Q96DU9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PABPC5Q96DU9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PABPC5Q96DU9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PABPC5Q96DU9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PABPC5Q96DU9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PABPC5Q96DU9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PABPC5Q96DU9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PABPC5Q96DU9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PABPC5Q96DU9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PABPC5Q96DU9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms