Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCTD12Q96CX2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCTD12Q96CX2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KCTD12Q96CX2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KCTD12Q96CX2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KCTD12Q96CX2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KCTD12Q96CX2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KCTD12Q96CX2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KCTD12Q96CX2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCTD12Q96CX2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCTD12Q96CX2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms