Protein–RNA interactions for Protein: Q96CW5

TUBGCP3, Gamma-tubulin complex component 3, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP3Q96CW5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBGCP3Q96CW5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TUBGCP3Q96CW5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBGCP3Q96CW5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms