Protein–RNA interactions for Protein: Q96CV9

OPTN, Optineurin, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTNQ96CV9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
OPTNQ96CV9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
OPTNQ96CV9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
OPTNQ96CV9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
OPTNQ96CV9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
OPTNQ96CV9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
OPTNQ96CV9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
OPTNQ96CV9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
OPTNQ96CV9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
OPTNQ96CV9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
OPTNQ96CV9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
OPTNQ96CV9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
OPTNQ96CV9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
OPTNQ96CV9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
OPTNQ96CV9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
OPTNQ96CV9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
OPTNQ96CV9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
OPTNQ96CV9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
OPTNQ96CV9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
OPTNQ96CV9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
OPTNQ96CV9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
OPTNQ96CV9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
OPTNQ96CV9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
OPTNQ96CV9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
OPTNQ96CV9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
OPTNQ96CV9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
OPTNQ96CV9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
OPTNQ96CV9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
OPTNQ96CV9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
OPTNQ96CV9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
OPTNQ96CV9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
OPTNQ96CV9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
OPTNQ96CV9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
OPTNQ96CV9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
OPTNQ96CV9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
OPTNQ96CV9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
OPTNQ96CV9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
OPTNQ96CV9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
OPTNQ96CV9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
OPTNQ96CV9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
OPTNQ96CV9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
OPTNQ96CV9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
OPTNQ96CV9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
OPTNQ96CV9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
OPTNQ96CV9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
OPTNQ96CV9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
OPTNQ96CV9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
OPTNQ96CV9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
OPTNQ96CV9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
OPTNQ96CV9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
OPTNQ96CV9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
OPTNQ96CV9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
OPTNQ96CV9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
OPTNQ96CV9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
OPTNQ96CV9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
OPTNQ96CV9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
OPTNQ96CV9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
OPTNQ96CV9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
OPTNQ96CV9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
OPTNQ96CV9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
OPTNQ96CV9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
OPTNQ96CV9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
OPTNQ96CV9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
OPTNQ96CV9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
OPTNQ96CV9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
OPTNQ96CV9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
OPTNQ96CV9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
OPTNQ96CV9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
OPTNQ96CV9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
OPTNQ96CV9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
OPTNQ96CV9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms