Protein–RNA interactions for Protein: Q96CK0

ZNF653, Zinc finger protein 653, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF653Q96CK0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF653Q96CK0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF653Q96CK0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF653Q96CK0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms