Protein–RNA interactions for Protein: Q96BZ4

PLD4, Phospholipase D4, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD4Q96BZ4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLD4Q96BZ4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLD4Q96BZ4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLD4Q96BZ4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLD4Q96BZ4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PLD4Q96BZ4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLD4Q96BZ4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLD4Q96BZ4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLD4Q96BZ4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLD4Q96BZ4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLD4Q96BZ4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLD4Q96BZ4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLD4Q96BZ4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLD4Q96BZ4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLD4Q96BZ4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLD4Q96BZ4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLD4Q96BZ4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLD4Q96BZ4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLD4Q96BZ4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLD4Q96BZ4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLD4Q96BZ4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLD4Q96BZ4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLD4Q96BZ4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLD4Q96BZ4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLD4Q96BZ4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms