Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMIGD2Q96BF3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TMIGD2Q96BF3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMIGD2Q96BF3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms