Protein–RNA interactions for Protein: Q969Y2

GTPBP3, tRNA modification GTPase GTPBP3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP3Q969Y2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTPBP3Q969Y2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTPBP3Q969Y2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTPBP3Q969Y2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTPBP3Q969Y2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTPBP3Q969Y2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTPBP3Q969Y2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTPBP3Q969Y2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTPBP3Q969Y2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTPBP3Q969Y2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTPBP3Q969Y2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTPBP3Q969Y2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTPBP3Q969Y2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTPBP3Q969Y2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTPBP3Q969Y2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTPBP3Q969Y2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTPBP3Q969Y2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTPBP3Q969Y2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GTPBP3Q969Y2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTPBP3Q969Y2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTPBP3Q969Y2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTPBP3Q969Y2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GTPBP3Q969Y2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTPBP3Q969Y2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTPBP3Q969Y2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GTPBP3Q969Y2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTPBP3Q969Y2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTPBP3Q969Y2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTPBP3Q969Y2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTPBP3Q969Y2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTPBP3Q969Y2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTPBP3Q969Y2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTPBP3Q969Y2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTPBP3Q969Y2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GTPBP3Q969Y2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTPBP3Q969Y2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTPBP3Q969Y2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTPBP3Q969Y2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTPBP3Q969Y2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GTPBP3Q969Y2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTPBP3Q969Y2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTPBP3Q969Y2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTPBP3Q969Y2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTPBP3Q969Y2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTPBP3Q969Y2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTPBP3Q969Y2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTPBP3Q969Y2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTPBP3Q969Y2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTPBP3Q969Y2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTPBP3Q969Y2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTPBP3Q969Y2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GTPBP3Q969Y2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTPBP3Q969Y2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTPBP3Q969Y2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTPBP3Q969Y2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTPBP3Q969Y2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GTPBP3Q969Y2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GTPBP3Q969Y2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTPBP3Q969Y2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTPBP3Q969Y2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTPBP3Q969Y2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTPBP3Q969Y2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GTPBP3Q969Y2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTPBP3Q969Y2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTPBP3Q969Y2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTPBP3Q969Y2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GTPBP3Q969Y2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTPBP3Q969Y2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTPBP3Q969Y2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTPBP3Q969Y2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTPBP3Q969Y2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTPBP3Q969Y2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTPBP3Q969Y2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTPBP3Q969Y2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTPBP3Q969Y2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTPBP3Q969Y2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GTPBP3Q969Y2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTPBP3Q969Y2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTPBP3Q969Y2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GTPBP3Q969Y2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTPBP3Q969Y2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTPBP3Q969Y2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GTPBP3Q969Y2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTPBP3Q969Y2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTPBP3Q969Y2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTPBP3Q969Y2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTPBP3Q969Y2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTPBP3Q969Y2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTPBP3Q969Y2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTPBP3Q969Y2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTPBP3Q969Y2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTPBP3Q969Y2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTPBP3Q969Y2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTPBP3Q969Y2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTPBP3Q969Y2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTPBP3Q969Y2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GTPBP3Q969Y2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTPBP3Q969Y2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTPBP3Q969Y2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GTPBP3Q969Y2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms