Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2E3Q969T4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2E3Q969T4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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