Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SNX21Q969T3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX21Q969T3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX21Q969T3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX21Q969T3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX21Q969T3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX21Q969T3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX21Q969T3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX21Q969T3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX21Q969T3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX21Q969T3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX21Q969T3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX21Q969T3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX21Q969T3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX21Q969T3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX21Q969T3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX21Q969T3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX21Q969T3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX21Q969T3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX21Q969T3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX21Q969T3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNX21Q969T3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNX21Q969T3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNX21Q969T3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNX21Q969T3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNX21Q969T3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNX21Q969T3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNX21Q969T3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNX21Q969T3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNX21Q969T3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX21Q969T3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX21Q969T3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX21Q969T3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX21Q969T3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX21Q969T3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX21Q969T3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX21Q969T3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX21Q969T3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX21Q969T3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX21Q969T3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX21Q969T3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX21Q969T3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX21Q969T3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX21Q969T3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX21Q969T3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX21Q969T3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX21Q969T3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNX21Q969T3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNX21Q969T3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNX21Q969T3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNX21Q969T3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SNX21Q969T3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SNX21Q969T3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
SNX21Q969T3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNX21Q969T3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNX21Q969T3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNX21Q969T3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNX21Q969T3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNX21Q969T3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNX21Q969T3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNX21Q969T3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms