Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NKD2Q969F2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NKD2Q969F2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms