Protein–RNA interactions for Protein: Q969E4

TCEAL3, Transcription elongation factor A protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEAL3Q969E4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCEAL3Q969E4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCEAL3Q969E4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCEAL3Q969E4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCEAL3Q969E4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TCEAL3Q969E4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCEAL3Q969E4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCEAL3Q969E4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms