Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP2A3Q93084 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP2A3Q93084 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms