Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC4Q92889 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms