Protein–RNA interactions for Protein: Q92845

KIFAP3, Kinesin-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFAP3Q92845 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIFAP3Q92845 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KIFAP3Q92845 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KIFAP3Q92845 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
KIFAP3Q92845 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIFAP3Q92845 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIFAP3Q92845 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIFAP3Q92845 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIFAP3Q92845 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
KIFAP3Q92845 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIFAP3Q92845 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIFAP3Q92845 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIFAP3Q92845 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIFAP3Q92845 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIFAP3Q92845 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIFAP3Q92845 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIFAP3Q92845 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIFAP3Q92845 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIFAP3Q92845 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIFAP3Q92845 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIFAP3Q92845 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KIFAP3Q92845 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIFAP3Q92845 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIFAP3Q92845 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIFAP3Q92845 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIFAP3Q92845 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIFAP3Q92845 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KIFAP3Q92845 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms