Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DNAAF4Q8WXU2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DNAAF4Q8WXU2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DNAAF4Q8WXU2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DNAAF4Q8WXU2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DNAAF4Q8WXU2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DNAAF4Q8WXU2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DNAAF4Q8WXU2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DNAAF4Q8WXU2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DNAAF4Q8WXU2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DNAAF4Q8WXU2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DNAAF4Q8WXU2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DNAAF4Q8WXU2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
DNAAF4Q8WXU2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
DNAAF4Q8WXU2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DNAAF4Q8WXU2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DNAAF4Q8WXU2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DNAAF4Q8WXU2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
DNAAF4Q8WXU2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
DNAAF4Q8WXU2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
DNAAF4Q8WXU2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DNAAF4Q8WXU2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
DNAAF4Q8WXU2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
DNAAF4Q8WXU2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
DNAAF4Q8WXU2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DNAAF4Q8WXU2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DNAAF4Q8WXU2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DNAAF4Q8WXU2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DNAAF4Q8WXU2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DNAAF4Q8WXU2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DNAAF4Q8WXU2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DNAAF4Q8WXU2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DNAAF4Q8WXU2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DNAAF4Q8WXU2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
DNAAF4Q8WXU2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DNAAF4Q8WXU2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DNAAF4Q8WXU2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DNAAF4Q8WXU2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
DNAAF4Q8WXU2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
DNAAF4Q8WXU2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
DNAAF4Q8WXU2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DNAAF4Q8WXU2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms