Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCG3Q8WXD2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCG3Q8WXD2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms