Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC4Q8WW27 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOBEC4Q8WW27 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms