Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR0

TRAF3IP1, TRAF3-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP1Q8TDR0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAF3IP1Q8TDR0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAF3IP1Q8TDR0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms