Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG2

ACTRT1, Actin-related protein T1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT1Q8TDG2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTRT1Q8TDG2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTRT1Q8TDG2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms