Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD17

ZNF398, Zinc finger protein 398, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF398Q8TD17 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF398Q8TD17 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF398Q8TD17 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms