Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBZ0

CCDC110, Coiled-coil domain-containing protein 110, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC110Q8TBZ0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC110Q8TBZ0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC110Q8TBZ0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC110Q8TBZ0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC110Q8TBZ0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC110Q8TBZ0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms