Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBN0

RAB3IL1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IL1Q8TBN0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3IL1Q8TBN0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms