Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE1

CNIH3, Protein cornichon homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3Q8TBE1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNIH3Q8TBE1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CNIH3Q8TBE1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNIH3Q8TBE1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNIH3Q8TBE1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNIH3Q8TBE1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNIH3Q8TBE1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNIH3Q8TBE1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNIH3Q8TBE1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNIH3Q8TBE1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNIH3Q8TBE1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNIH3Q8TBE1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNIH3Q8TBE1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNIH3Q8TBE1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNIH3Q8TBE1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CNIH3Q8TBE1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNIH3Q8TBE1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNIH3Q8TBE1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNIH3Q8TBE1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNIH3Q8TBE1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNIH3Q8TBE1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNIH3Q8TBE1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNIH3Q8TBE1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNIH3Q8TBE1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNIH3Q8TBE1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNIH3Q8TBE1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNIH3Q8TBE1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNIH3Q8TBE1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNIH3Q8TBE1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNIH3Q8TBE1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNIH3Q8TBE1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNIH3Q8TBE1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CNIH3Q8TBE1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNIH3Q8TBE1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CNIH3Q8TBE1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms