Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAX9

GSDMB, Gasdermin-B, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMBQ8TAX9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSDMBQ8TAX9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms