Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAL5

C9orf43, Uncharacterized protein C9orf43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf43Q8TAL5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9orf43Q8TAL5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C9orf43Q8TAL5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
C9orf43Q8TAL5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.33■■□□□ 1
C9orf43Q8TAL5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms