Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHY2

RFWD2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, humanhuman

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD2Q8NHY2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RFWD2Q8NHY2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFWD2Q8NHY2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFWD2Q8NHY2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFWD2Q8NHY2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFWD2Q8NHY2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFWD2Q8NHY2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFWD2Q8NHY2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFWD2Q8NHY2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFWD2Q8NHY2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFWD2Q8NHY2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFWD2Q8NHY2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFWD2Q8NHY2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFWD2Q8NHY2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFWD2Q8NHY2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFWD2Q8NHY2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RFWD2Q8NHY2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFWD2Q8NHY2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFWD2Q8NHY2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFWD2Q8NHY2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFWD2Q8NHY2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RFWD2Q8NHY2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFWD2Q8NHY2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFWD2Q8NHY2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFWD2Q8NHY2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFWD2Q8NHY2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFWD2Q8NHY2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFWD2Q8NHY2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFWD2Q8NHY2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFWD2Q8NHY2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFWD2Q8NHY2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFWD2Q8NHY2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFWD2Q8NHY2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFWD2Q8NHY2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFWD2Q8NHY2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFWD2Q8NHY2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFWD2Q8NHY2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFWD2Q8NHY2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms