Protein–RNA interactions for Protein: Q8NER5

ACVR1C, Activin receptor type-1C, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1CQ8NER5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACVR1CQ8NER5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACVR1CQ8NER5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACVR1CQ8NER5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms