Protein–RNA interactions for Protein: Q8NER1

TRPV1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV1Q8NER1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRPV1Q8NER1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRPV1Q8NER1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRPV1Q8NER1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRPV1Q8NER1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRPV1Q8NER1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRPV1Q8NER1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRPV1Q8NER1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRPV1Q8NER1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRPV1Q8NER1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRPV1Q8NER1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRPV1Q8NER1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRPV1Q8NER1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRPV1Q8NER1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRPV1Q8NER1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRPV1Q8NER1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRPV1Q8NER1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRPV1Q8NER1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRPV1Q8NER1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRPV1Q8NER1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRPV1Q8NER1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRPV1Q8NER1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRPV1Q8NER1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TRPV1Q8NER1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRPV1Q8NER1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRPV1Q8NER1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRPV1Q8NER1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TRPV1Q8NER1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRPV1Q8NER1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRPV1Q8NER1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRPV1Q8NER1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRPV1Q8NER1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRPV1Q8NER1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRPV1Q8NER1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRPV1Q8NER1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRPV1Q8NER1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRPV1Q8NER1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRPV1Q8NER1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRPV1Q8NER1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRPV1Q8NER1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRPV1Q8NER1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRPV1Q8NER1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms