Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK8

FAM46D, Putative nucleotidyltransferase FAM46D, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46DQ8NEK8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM46DQ8NEK8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAM46DQ8NEK8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAM46DQ8NEK8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAM46DQ8NEK8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM46DQ8NEK8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM46DQ8NEK8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM46DQ8NEK8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM46DQ8NEK8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM46DQ8NEK8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM46DQ8NEK8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM46DQ8NEK8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM46DQ8NEK8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM46DQ8NEK8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM46DQ8NEK8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM46DQ8NEK8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM46DQ8NEK8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM46DQ8NEK8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM46DQ8NEK8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM46DQ8NEK8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM46DQ8NEK8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM46DQ8NEK8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM46DQ8NEK8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM46DQ8NEK8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM46DQ8NEK8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM46DQ8NEK8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM46DQ8NEK8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM46DQ8NEK8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM46DQ8NEK8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FAM46DQ8NEK8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FAM46DQ8NEK8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FAM46DQ8NEK8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FAM46DQ8NEK8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms