Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEG7

DENND6B, Protein DENND6B, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND6BQ8NEG7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND6BQ8NEG7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND6BQ8NEG7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND6BQ8NEG7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND6BQ8NEG7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND6BQ8NEG7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND6BQ8NEG7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND6BQ8NEG7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND6BQ8NEG7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DENND6BQ8NEG7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND6BQ8NEG7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND6BQ8NEG7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND6BQ8NEG7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND6BQ8NEG7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND6BQ8NEG7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND6BQ8NEG7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND6BQ8NEG7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND6BQ8NEG7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND6BQ8NEG7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND6BQ8NEG7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND6BQ8NEG7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DENND6BQ8NEG7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND6BQ8NEG7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND6BQ8NEG7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND6BQ8NEG7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND6BQ8NEG7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND6BQ8NEG7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND6BQ8NEG7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND6BQ8NEG7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND6BQ8NEG7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DENND6BQ8NEG7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DENND6BQ8NEG7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DENND6BQ8NEG7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DENND6BQ8NEG7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DENND6BQ8NEG7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DENND6BQ8NEG7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DENND6BQ8NEG7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DENND6BQ8NEG7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DENND6BQ8NEG7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DENND6BQ8NEG7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DENND6BQ8NEG7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms