Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
PIK3C3Q8NEB9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PIK3C3Q8NEB9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms