Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPC24Q8NBT2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPC24Q8NBT2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPC24Q8NBT2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPC24Q8NBT2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPC24Q8NBT2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPC24Q8NBT2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPC24Q8NBT2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPC24Q8NBT2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPC24Q8NBT2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPC24Q8NBT2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPC24Q8NBT2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPC24Q8NBT2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPC24Q8NBT2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPC24Q8NBT2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SPC24Q8NBT2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SPC24Q8NBT2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPC24Q8NBT2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPC24Q8NBT2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms