Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
TMEM87AQ8NBN3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM87AQ8NBN3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM87AQ8NBN3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM87AQ8NBN3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM87AQ8NBN3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM87AQ8NBN3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM87AQ8NBN3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM87AQ8NBN3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM87AQ8NBN3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM87AQ8NBN3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM87AQ8NBN3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM87AQ8NBN3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM87AQ8NBN3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM87AQ8NBN3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TMEM87AQ8NBN3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM87AQ8NBN3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM87AQ8NBN3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM87AQ8NBN3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM87AQ8NBN3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM87AQ8NBN3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM87AQ8NBN3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM87AQ8NBN3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM87AQ8NBN3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM87AQ8NBN3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM87AQ8NBN3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM87AQ8NBN3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM87AQ8NBN3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM87AQ8NBN3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM87AQ8NBN3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM87AQ8NBN3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM87AQ8NBN3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM87AQ8NBN3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM87AQ8NBN3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM87AQ8NBN3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM87AQ8NBN3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM87AQ8NBN3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM87AQ8NBN3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM87AQ8NBN3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM87AQ8NBN3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM87AQ8NBN3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM87AQ8NBN3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms