Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM71DQ8N9W8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM71DQ8N9W8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM71DQ8N9W8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM71DQ8N9W8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM71DQ8N9W8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM71DQ8N9W8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM71DQ8N9W8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM71DQ8N9W8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM71DQ8N9W8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM71DQ8N9W8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM71DQ8N9W8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM71DQ8N9W8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM71DQ8N9W8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM71DQ8N9W8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM71DQ8N9W8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM71DQ8N9W8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM71DQ8N9W8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM71DQ8N9W8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM71DQ8N9W8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM71DQ8N9W8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM71DQ8N9W8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM71DQ8N9W8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM71DQ8N9W8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM71DQ8N9W8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM71DQ8N9W8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM71DQ8N9W8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM71DQ8N9W8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM71DQ8N9W8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM71DQ8N9W8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM71DQ8N9W8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM71DQ8N9W8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM71DQ8N9W8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM71DQ8N9W8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM71DQ8N9W8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM71DQ8N9W8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM71DQ8N9W8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM71DQ8N9W8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM71DQ8N9W8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM71DQ8N9W8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM71DQ8N9W8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM71DQ8N9W8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms