Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9S9

SNX31, Sorting nexin-31, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX31Q8N9S9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX31Q8N9S9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX31Q8N9S9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX31Q8N9S9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX31Q8N9S9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX31Q8N9S9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX31Q8N9S9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX31Q8N9S9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX31Q8N9S9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX31Q8N9S9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX31Q8N9S9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX31Q8N9S9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX31Q8N9S9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX31Q8N9S9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX31Q8N9S9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX31Q8N9S9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX31Q8N9S9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SNX31Q8N9S9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX31Q8N9S9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX31Q8N9S9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX31Q8N9S9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX31Q8N9S9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX31Q8N9S9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX31Q8N9S9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX31Q8N9S9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX31Q8N9S9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms