Protein–RNA interactions for Protein: Q8N140

EID3, EP300-interacting inhibitor of differentiation 3, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EID3Q8N140 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EID3Q8N140 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EID3Q8N140 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EID3Q8N140 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EID3Q8N140 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EID3Q8N140 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EID3Q8N140 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EID3Q8N140 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EID3Q8N140 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EID3Q8N140 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EID3Q8N140 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EID3Q8N140 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EID3Q8N140 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EID3Q8N140 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EID3Q8N140 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EID3Q8N140 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EID3Q8N140 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EID3Q8N140 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EID3Q8N140 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EID3Q8N140 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EID3Q8N140 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EID3Q8N140 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EID3Q8N140 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EID3Q8N140 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EID3Q8N140 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EID3Q8N140 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EID3Q8N140 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EID3Q8N140 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EID3Q8N140 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EID3Q8N140 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EID3Q8N140 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EID3Q8N140 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EID3Q8N140 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EID3Q8N140 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EID3Q8N140 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EID3Q8N140 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EID3Q8N140 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EID3Q8N140 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EID3Q8N140 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EID3Q8N140 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EID3Q8N140 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EID3Q8N140 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EID3Q8N140 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EID3Q8N140 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms