Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HACE1Q8IYU2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HACE1Q8IYU2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms