Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWX8

CHERP, Calcium homeostasis endoplasmic reticulum protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHERPQ8IWX8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHERPQ8IWX8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHERPQ8IWX8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHERPQ8IWX8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHERPQ8IWX8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHERPQ8IWX8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHERPQ8IWX8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHERPQ8IWX8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHERPQ8IWX8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHERPQ8IWX8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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