Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC50Q8IVM0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC50Q8IVM0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms