Protein–RNA interactions for Protein: Q86YC2

PALB2, Partner and localizer of BRCA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALB2Q86YC2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PALB2Q86YC2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PALB2Q86YC2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PALB2Q86YC2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PALB2Q86YC2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PALB2Q86YC2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms