Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PPFIBP1Q86W92 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPFIBP1Q86W92 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPFIBP1Q86W92 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms