Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNMB4Q86W47 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNMB4Q86W47 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KCNMB4Q86W47 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNMB4Q86W47 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNMB4Q86W47 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNMB4Q86W47 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNMB4Q86W47 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNMB4Q86W47 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNMB4Q86W47 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNMB4Q86W47 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNMB4Q86W47 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNMB4Q86W47 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNMB4Q86W47 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNMB4Q86W47 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNMB4Q86W47 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNMB4Q86W47 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNMB4Q86W47 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNMB4Q86W47 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms