Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCA5Q86VQ0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCA5Q86VQ0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCA5Q86VQ0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms