Protein–RNA interactions for Protein: Q86U70

LDB1, LIM domain-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB1Q86U70 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDB1Q86U70 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LDB1Q86U70 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LDB1Q86U70 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LDB1Q86U70 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LDB1Q86U70 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms