Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE2Q1Q7Z7E8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE2Q1Q7Z7E8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBE2Q1Q7Z7E8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBE2Q1Q7Z7E8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBE2Q1Q7Z7E8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE2Q1Q7Z7E8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE2Q1Q7Z7E8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE2Q1Q7Z7E8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE2Q1Q7Z7E8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE2Q1Q7Z7E8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE2Q1Q7Z7E8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBE2Q1Q7Z7E8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE2Q1Q7Z7E8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE2Q1Q7Z7E8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE2Q1Q7Z7E8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBE2Q1Q7Z7E8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE2Q1Q7Z7E8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE2Q1Q7Z7E8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE2Q1Q7Z7E8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBE2Q1Q7Z7E8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE2Q1Q7Z7E8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE2Q1Q7Z7E8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE2Q1Q7Z7E8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE2Q1Q7Z7E8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE2Q1Q7Z7E8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE2Q1Q7Z7E8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBE2Q1Q7Z7E8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBE2Q1Q7Z7E8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBE2Q1Q7Z7E8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBE2Q1Q7Z7E8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
UBE2Q1Q7Z7E8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBE2Q1Q7Z7E8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBE2Q1Q7Z7E8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBE2Q1Q7Z7E8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBE2Q1Q7Z7E8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBE2Q1Q7Z7E8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
UBE2Q1Q7Z7E8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBE2Q1Q7Z7E8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
UBE2Q1Q7Z7E8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
UBE2Q1Q7Z7E8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE2Q1Q7Z7E8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE2Q1Q7Z7E8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE2Q1Q7Z7E8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE2Q1Q7Z7E8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE2Q1Q7Z7E8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE2Q1Q7Z7E8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE2Q1Q7Z7E8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE2Q1Q7Z7E8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBE2Q1Q7Z7E8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE2Q1Q7Z7E8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE2Q1Q7Z7E8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE2Q1Q7Z7E8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE2Q1Q7Z7E8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE2Q1Q7Z7E8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE2Q1Q7Z7E8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE2Q1Q7Z7E8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE2Q1Q7Z7E8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE2Q1Q7Z7E8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE2Q1Q7Z7E8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE2Q1Q7Z7E8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE2Q1Q7Z7E8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBE2Q1Q7Z7E8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE2Q1Q7Z7E8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE2Q1Q7Z7E8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE2Q1Q7Z7E8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE2Q1Q7Z7E8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE2Q1Q7Z7E8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE2Q1Q7Z7E8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE2Q1Q7Z7E8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE2Q1Q7Z7E8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBE2Q1Q7Z7E8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE2Q1Q7Z7E8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE2Q1Q7Z7E8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE2Q1Q7Z7E8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE2Q1Q7Z7E8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE2Q1Q7Z7E8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE2Q1Q7Z7E8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE2Q1Q7Z7E8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE2Q1Q7Z7E8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE2Q1Q7Z7E8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE2Q1Q7Z7E8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE2Q1Q7Z7E8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE2Q1Q7Z7E8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE2Q1Q7Z7E8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE2Q1Q7Z7E8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE2Q1Q7Z7E8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE2Q1Q7Z7E8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE2Q1Q7Z7E8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE2Q1Q7Z7E8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBE2Q1Q7Z7E8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBE2Q1Q7Z7E8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms