Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YTHDF3Q7Z739 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
YTHDF3Q7Z739 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YTHDF3Q7Z739 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YTHDF3Q7Z739 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YTHDF3Q7Z739 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YTHDF3Q7Z739 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YTHDF3Q7Z739 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YTHDF3Q7Z739 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YTHDF3Q7Z739 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YTHDF3Q7Z739 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YTHDF3Q7Z739 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YTHDF3Q7Z739 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YTHDF3Q7Z739 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YTHDF3Q7Z739 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YTHDF3Q7Z739 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YTHDF3Q7Z739 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YTHDF3Q7Z739 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YTHDF3Q7Z739 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YTHDF3Q7Z739 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YTHDF3Q7Z739 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YTHDF3Q7Z739 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YTHDF3Q7Z739 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YTHDF3Q7Z739 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YTHDF3Q7Z739 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YTHDF3Q7Z739 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YTHDF3Q7Z739 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YTHDF3Q7Z739 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YTHDF3Q7Z739 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YTHDF3Q7Z739 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YTHDF3Q7Z739 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YTHDF3Q7Z739 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YTHDF3Q7Z739 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YTHDF3Q7Z739 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YTHDF3Q7Z739 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YTHDF3Q7Z739 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YTHDF3Q7Z739 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YTHDF3Q7Z739 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YTHDF3Q7Z739 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YTHDF3Q7Z739 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YTHDF3Q7Z739 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YTHDF3Q7Z739 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YTHDF3Q7Z739 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YTHDF3Q7Z739 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YTHDF3Q7Z739 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YTHDF3Q7Z739 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YTHDF3Q7Z739 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YTHDF3Q7Z739 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YTHDF3Q7Z739 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YTHDF3Q7Z739 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YTHDF3Q7Z739 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
YTHDF3Q7Z739 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms