Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Q1

SLC46A3, Solute carrier family 46 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC46A3Q7Z3Q1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLC46A3Q7Z3Q1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC46A3Q7Z3Q1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC46A3Q7Z3Q1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC46A3Q7Z3Q1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC46A3Q7Z3Q1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC46A3Q7Z3Q1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC46A3Q7Z3Q1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SLC46A3Q7Z3Q1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC46A3Q7Z3Q1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC46A3Q7Z3Q1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC46A3Q7Z3Q1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC46A3Q7Z3Q1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC46A3Q7Z3Q1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC46A3Q7Z3Q1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC46A3Q7Z3Q1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC46A3Q7Z3Q1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC46A3Q7Z3Q1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC46A3Q7Z3Q1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC46A3Q7Z3Q1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC46A3Q7Z3Q1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC46A3Q7Z3Q1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC46A3Q7Z3Q1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC46A3Q7Z3Q1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC46A3Q7Z3Q1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC46A3Q7Z3Q1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC46A3Q7Z3Q1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC46A3Q7Z3Q1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC46A3Q7Z3Q1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC46A3Q7Z3Q1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLC46A3Q7Z3Q1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
SLC46A3Q7Z3Q1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
SLC46A3Q7Z3Q1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLC46A3Q7Z3Q1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
SLC46A3Q7Z3Q1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC46A3Q7Z3Q1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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